Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD3O95983 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD3O95983 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD3O95983 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MBD3O95983 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MBD3O95983 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms