Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms