Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACOX3O15254 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms