Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLGNO14967 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLGNO14967 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLGNO14967 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLGNO14967 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLGNO14967 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms