Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS6O14544 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOCS6O14544 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms