Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGRNO00468 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGRNO00468 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AGRNO00468 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AGRNO00468 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms