Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmgxb3G3X9M3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms