Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn2aA0A0J9YTW6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms