Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3550W4VSN7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3550W4VSN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms