Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb6Q9Z0T9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms