Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TPCN1Q9ULQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPCN1Q9ULQ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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