Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN16Q9UKR8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms