Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MBD1Q9UIS9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms