Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM8A1Q9UBU6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms