Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC6Q9UBN7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms