Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP2BPQ9P2M1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP2BPQ9P2M1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP2BPQ9P2M1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP2BPQ9P2M1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRP2BPQ9P2M1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms