Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms