Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECHDC1Q9NTX5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECHDC1Q9NTX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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