Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SERINC1Q9NRX5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SERINC1Q9NRX5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms