Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms