Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Z8

C2orf40, Augurin, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf40Q9H1Z8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf40Q9H1Z8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf40Q9H1Z8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms