Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM9Q9C026 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms