Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM54Q9BYV2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRIM54Q9BYV2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms