Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A2Q9BY10 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms