Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP4Q9BWG4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms