Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms