Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms