Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF1Q9BSM1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms