Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK3Q96L96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms