Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX27Q96L92 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms