Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMTM7Q96FZ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM7Q96FZ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms