Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms