Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HJURPQ8NCD3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms