Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG6Q86US8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMG6Q86US8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMG6Q86US8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMG6Q86US8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms