Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM5Q71RC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM5Q71RC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms