Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIAT1Q6ZQX7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIAT1Q6ZQX7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms