Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q6P435 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q6P435 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6P435 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6P435 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6P435 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6P435 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6P435 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6P435 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6P435 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms