Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms