Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm21440Q3TTD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm21440Q3TTD8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm21440Q3TTD8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21440Q3TTD8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm21440Q3TTD8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm21440Q3TTD8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm21440Q3TTD8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21440Q3TTD8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm21440Q3TTD8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21440Q3TTD8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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