Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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