Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA3Q16281 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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