Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85BQ15834 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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