Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERC1Q15751 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms