Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAPSNQ13702 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAPSNQ13702 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms