Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms