Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.428e-12■■■■■ 27.5
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PABPC4Q13310 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 27.5
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PABPC4Q13310 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.115e-13■■■■■ 27.4
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PABPC4Q13310 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-12■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.194e-12■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.196e-7■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 POMGNT1-205ENST00000475642 407 ntTSL 317.24■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-207ENST00000470690 1729 ntTSL 526.83■■□□□ 1.893e-11■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-216ENST00000523903 1534 ntTSL 1 (best)26.24■■□□□ 1.793e-11■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-201ENST00000393910 1253 ntTSL 225.69■■□□□ 1.73e-11■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.453e-11■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-206ENST00000469698 1573 ntTSL 322.48■■□□□ 1.193e-11■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-202ENST00000415460 730 ntTSL 521.91■■□□□ 1.13e-11■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.913e-11■■■■■ 27.4
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PABPC4Q13310 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 214.42□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 OXA1L-207ENST00000481218 1596 ntTSL 59.68□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 27.4
PABPC4Q13310 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-10■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 208.3 ms