Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK2Q13002 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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