Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF3C1Q12789 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GTF3C1Q12789 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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GTF3C1Q12789 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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GTF3C1Q12789 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C1Q12789 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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