Protein–RNA interactions for Protein: Q12141

TY1B-GR1, Transposon Ty1-GR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR1Q12141 NUP192YJL039C 5052 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 RNA14YMR061W 2034 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 MIP6YHR015W 1980 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 BRE1YDL074C 2103 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 MST28YAR033W 705 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 BUD21YOR078W 645 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 BNI4YNL233W 2679 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 YIG1YPL201C 1386 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 DYN1YKR054C 12279 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 ADR1YDR216W 3972 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 HUG1YML058W-A 207 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 TVP18YMR071C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 SMA1YPL027W 738 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 RRG8YPR116W 834 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 DNL4YOR005C 2835 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 SEY1YOR165W 2331 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 SEF1YBL066C 3447 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 CBP2YHL038C 1893 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1B-GR1Q12141 ERB1YMR049C 2424 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 LST7YGR057C 729 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 RPS11BYBR048W 471 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 IRR1YIL026C 3453 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 NIC96YFR002W 2520 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YDR442WYDR442W 393 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 LIF1YGL090W 1266 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 ARC19YKL013C 516 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YBR300CYBR300C 498 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 FLO11YIR019C 4104 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SUC2YIL162W 1599 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YHP1YDR451C 1062 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 CPR7YJR032W 1182 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YLL044WYLL044W 447 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 PCL8YPL219W 1479 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 ARP5YNL059C 2268 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YCG1YDR325W 3108 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 RRM3YHR031C 2172 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 RBK1YCR036W 1002 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YDR209CYDR209C 414 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 GIP1YBR045C 1920 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SIP1YDR422C 2448 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SAP185YJL098W 3177 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SPI1YER150W 447 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SAE3YHR079C-A 276 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YPL142CYPL142C 318 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 KAP104YBR017C 2757 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 MET5YJR137C 4329 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YGL101WYGL101W 648 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 AIM19YIL087C 474 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 FRM2YCL026C-A 582 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 UBR2YLR024C 5619 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 RAD5YLR032W 3510 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YNL193WYNL193W 1677 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 MFM1YPL060W 1242 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 FKS1YLR342W 5631 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 TCP1YDR212W 1680 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 DBP7YKR024C 2229 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 ETP1YHL010C 1758 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 KIN82YCR091W 2163 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 RTN1YDR233C 888 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 YGR226CYGR226C 210 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 TEC1YBR083W 1461 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 LAP2YNL045W 2016 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 PCL7YIL050W 858 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SYM1YLR251W 594 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 SAS2YMR127C 1017 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-GR1Q12141 PIK1YNL267W 3201 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 MPH1YIR002C 2982 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 MRPL38YKL170W 417 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YKR051WYKR051W 1257 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 TAF2YCR042C 4224 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YKR015CYKR015C 1707 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 STU1YBL034C 4542 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 CFT1YDR301W 4074 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YGR126WYGR126W 693 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YAP7YOL028C 738 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 GLN4YOR168W 2430 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YDR431WYDR431W 312 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 PFA5YDR459C 1125 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 ADH4YGL256W 1149 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 RCE1YMR274C 948 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 SPO1YNL012W 1896 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YHL037CYHL037C 402 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YLR365WYLR365W 333 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 SET2YJL168C 2202 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 MAK21YDR060W 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 NDT80YHR124W 1884 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 MGT1YDL200C 567 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YGR168CYGR168C 1131 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 ZDS2YML109W 2829 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YJL016WYJL016W 1686 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 TIF4631YGR162W 2859 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 MLH1YMR167W 2310 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 APL4YPR029C 2499 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 IZH1YDR492W 951 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 YGR073CYGR073C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 GCY1YOR120W 939 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-GR1Q12141 SAK1YER129W 3429 nt2.85□□□□□ -1.95
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