Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 NUP192YJL039C 5052 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 RNA14YMR061W 2034 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 MIP6YHR015W 1980 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 BRE1YDL074C 2103 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 MST28YAR033W 705 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 BUD21YOR078W 645 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 BNI4YNL233W 2679 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 YIG1YPL201C 1386 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 DYN1YKR054C 12279 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 ADR1YDR216W 3972 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 HUG1YML058W-A 207 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 TVP18YMR071C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 SMA1YPL027W 738 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 RRG8YPR116W 834 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 DNL4YOR005C 2835 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 SEY1YOR165W 2331 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 SEF1YBL066C 3447 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 CBP2YHL038C 1893 nt2.96□□□□□ -1.93
TY1B-LR1Q12088 ERB1YMR049C 2424 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 LST7YGR057C 729 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 RPS11BYBR048W 471 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 IRR1YIL026C 3453 nt2.96□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 NIC96YFR002W 2520 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YDR442WYDR442W 393 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 LIF1YGL090W 1266 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 ARC19YKL013C 516 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YBR300CYBR300C 498 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 FLO11YIR019C 4104 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SUC2YIL162W 1599 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YHP1YDR451C 1062 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 CPR7YJR032W 1182 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YLL044WYLL044W 447 nt2.95□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 PCL8YPL219W 1479 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 ARP5YNL059C 2268 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YCG1YDR325W 3108 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 RRM3YHR031C 2172 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 RBK1YCR036W 1002 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YDR209CYDR209C 414 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 GIP1YBR045C 1920 nt2.94□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SIP1YDR422C 2448 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SAP185YJL098W 3177 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SPI1YER150W 447 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SAE3YHR079C-A 276 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YPL142CYPL142C 318 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 KAP104YBR017C 2757 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 MET5YJR137C 4329 nt2.93□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YGL101WYGL101W 648 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 AIM19YIL087C 474 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 FRM2YCL026C-A 582 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 UBR2YLR024C 5619 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 RAD5YLR032W 3510 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YNL193WYNL193W 1677 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 MFM1YPL060W 1242 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 FKS1YLR342W 5631 nt2.92□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 TCP1YDR212W 1680 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 DBP7YKR024C 2229 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 ETP1YHL010C 1758 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 KIN82YCR091W 2163 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 RTN1YDR233C 888 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 YGR226CYGR226C 210 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 TEC1YBR083W 1461 nt2.91□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 LAP2YNL045W 2016 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 PCL7YIL050W 858 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SYM1YLR251W 594 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 SAS2YMR127C 1017 nt2.9□□□□□ -1.94
TY1B-LR1Q12088 PIK1YNL267W 3201 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 MPH1YIR002C 2982 nt2.9□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 MRPL38YKL170W 417 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YKR051WYKR051W 1257 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 TAF2YCR042C 4224 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YKR015CYKR015C 1707 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 STU1YBL034C 4542 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 CFT1YDR301W 4074 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YGR126WYGR126W 693 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YAP7YOL028C 738 nt2.89□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 GLN4YOR168W 2430 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YDR431WYDR431W 312 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 PFA5YDR459C 1125 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 ADH4YGL256W 1149 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 RCE1YMR274C 948 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 SPO1YNL012W 1896 nt2.88□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YHL037CYHL037C 402 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YLR365WYLR365W 333 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 SET2YJL168C 2202 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 MAK21YDR060W 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 NDT80YHR124W 1884 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 MGT1YDL200C 567 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YGR168CYGR168C 1131 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 ZDS2YML109W 2829 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YJL016WYJL016W 1686 nt2.87□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 TIF4631YGR162W 2859 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 MLH1YMR167W 2310 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 APL4YPR029C 2499 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 IZH1YDR492W 951 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 YGR073CYGR073C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 GCY1YOR120W 939 nt2.86□□□□□ -1.95
TY1B-LR1Q12088 SAK1YER129W 3429 nt2.85□□□□□ -1.95
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